Al-Muhafadhotu Alal Qodimis Sholeh Wal Akhdu Bil Jadidil Ashlah
Sejak awal, Pesantren Al Falah memulai kegiatan mengajar dengan metode pesantren klasik, yaitu musafahah atau sorogan. Fokus utama pendidikan kami adalah membaca Al Qur'an dan mengkaji Kitab Kuning, yang meliputi bidang Aqidah, Akhlaq, dan Fiqih.
Pesantren ini dirintis dan didirikan oleh K. Zainal Abidin pada tahun 1973. Kemudian, setelah Abah Jen (K. Zainal Abidin) wafat pada tahun 1980, tonggak kepemimpinan pesantren dilanjutkan oleh istri beliau, Ibu Nyai Nuryatin, sejak tahun 1980 hingga tahun 2023.
Pada tahun 2022, sebagai langkah responsif terhadap perkembangan zaman tanpa mereduksi idealisme pesantren, dibentuklah Akta Yayasan Kemenkumham. Yayasan ini resmi diberi nama Yayasan Pondok Pesantren Subontoro (YPP Subontoro), yang diinisiasi oleh 4 orang, salah satunya Putra Bungsu Abah Jen, yaitu Pak Hakim Zain Yayasan ini menaungi berbagai lembaga dan bidang operasional seperti Dakwah, Pendidikan, dan Sosial.
Mengintegrasikan TPQ, Madin, dan rintisan SMP formal yang disempurnakan dengan ruang praktik atas ilmu yang dipelajari.
Aktif membina masyarakat melalui berbagai forum dakwah, kajian, dan silaturahmi antar komunitas.
Senantiasa melakukan upaya perbaikan dan kontekstualisasi dalam merekonstruksi bangunan sosio-kultural dan manajemen.